为了适应学校教育改革和教学研究工作的需要，1988年1月3日，学校建立了医学教育研究室。广泛开展医学教育研究，组织学术交流，编辑出版了《教研与管理》专刊，向卫生部申报了教学研究指标课题，参加协作课题《高等医学院校教师教学质量评价指标体系的研究》。
为了加强精神病学的教学工作，4月6日，学校同锦州市康宁医院联合建立了精神病学教研室，教研室设在康宁医院，隶属学校医学系，接受医学系与康宁医院双重领导。
1988年，学校召开了以“提高学生临床实践能力”为中心议题的临床教学工作会议。确定了重点实习内、外、妇、儿科的长短线临床实习方案，调整了县级医院实习和社会实践活动的时间、内容和方式，修订毕业实习报告。加强了临床实习基地的建设，制定了有关临床教学管理、学生管理和师资管理等制度。新的实习方案的实施，促进了教学质量的提高。
1988年9月，口腔专业和医学影像专业60名新生入学，从而结束了建校以来只有单一专业的历史。学校制定了口腔专业和医学影像专业的教学计划，建立了放射影像、超声影像、核素影像三个专业教研室，满足了教学上的需要。
9月，在北京召开的全国第二届实验动物工作会议上，学校被卫生部授予“先进集体”荣誉称号，颁发了荣誉证书和奖状。
1989年6月，经辽宁省教委批准，学校耳鼻喉专业开始招生，使专业由三个增加到四个。学校首次开展评选优秀教学成果活动，共评出十项校级优秀教学成果，其中有一项获省一等奖，两项获省二等奖。
9月，为了加快对青年教师的培养，学校开始举办青年教师岗前培训班，开办青年教师外语“四会班”，鼓励青年教师攻读硕士学位和博士学位，出国留学的机会逐渐向青年教师倾斜。
